CexoR

DOI:10.18129 / B9.bioc.CexoR

在ChIP-exo复制中发现高分辨率蛋白质- dna相互作用的R包

Bioconductor版本:Release (3.6)

ChIP-exo复制中链特异性峰对调用。累积Skellam分布函数(封装' Skellam ')用于检测每条DNA链(峰对)上反对符号的显着归一化计数差异。使用包'idr'估计跨生物重复重叠峰对的不可复制发现率。

作者:Pedro Madrigal

维护者:Pedro Madrigal

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文档

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PDF	R脚本	CexoR装饰图案
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	遗传学，测序，软件，转录
版本	1.16.0
在Bioconductor中	BioC 2.13 (R-3.0)(4.5年)
许可证	artist -2.0 | GPL-2 +文件许可
取决于	R (>= 2.10.0)，S4Vectors，IRanges
进口	Rsamtools，GenomeInfoDb，GenomicRanges，rtracklayer，印尼盾，RColorBrewer，genomation
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	CexoR_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	CexoR_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CexoR_1.16.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/CexoR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CexoR/
软件包下载报告	下载数据