CountClust

DOI:10.18129 / B9.bioc.CountClust

利用隶属度模型聚类和可视化RNA-Seq表达数据

Bioconductor版本:Release (3.6)

将隶属度模型(GoM，也称为混合模型)与聚类RNA-seq基因表达计数数据进行拟合，识别驱动聚类隶属度的特征基因，并提供对聚类隶属度的可视化总结。

作者:Kushal Dey [aut, cre]， Joyce Hsiao [aut]， Matthew Stephens [aut]

维护者:Kushal Dey

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文档

超文本标记语言	R脚本	装饰图案的标题
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细节

biocViews	聚类，GeneExpression，RNASeq，测序，软件，StatisticalMethod，可视化
版本	1.4.1
Bioconductor自	BioC 3.3 (R-3.3)(两年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.2),ggplot2(> = 2.1.0的)
进口	maptpx，SQUAREM，大满贯，plyr(> = 1.7.1上),cowplot，gtools，flexmix，激情似火，limma平行,reshape2，统计，utils，图形，grDevices
链接
建议	knitr，kableExtra，BiocStyle，Biobase，roxygen2，RColorBrewer，devtools，xtable
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/kkdey/CountClust
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包档案

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源包	CountClust_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	CountClust_1.4.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CountClust_1.4.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CountClust
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CountClust/
包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档