CrispRVariants

DOI:10.18129 / B9.bioc.CrispRVariants

用于计数和可视化目标位置突变的工具

Bioconductor版本:Release (3.6)

crisprvariant提供了分析CRISPR-Cas9突变测序实验结果的工具，或其他测序实验，其中给定区域内的变异是感兴趣的。这些工具允许用户定位相对于任何基因组位置(例如Cas9切割位点)的变异等位基因组合，绘制等位基因组合，并通过灵活过滤不相关的变异来计算突变率。

作者:海伦·林赛[作家，作家]

维护者:海伦·林赛<海伦。林赛在uzh.ch>

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PDF	R脚本	CrispRVariants
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文本		新闻

细节

biocViews	CRISPR，DataRepresentation，GeneticVariability，GenomicVariation，软件，VariantDetection，可视化
版本	1.6.0
在Bioconductor中	BioC 3.3 (R-3.3)(2年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.4)，ggplot2(> = 2.2.0)
进口	AnnotationDbi，BiocParallel，Biostrings、方法、GenomeInfoDb，GenomicAlignments，GenomicRanges， grDevices, grid，gridExtra，IRanges，reshape2，Rsamtools，S4Vectors(>= 0.9.38)
链接
建议	BiocStyle，gdata，GenomicFeatures，knitr，rmarkdown，rtracklayer，sangerseqR，testthat，VariantAnnotation
SystemRequirements
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包档案

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源包	CrispRVariants_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	CrispRVariants_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CrispRVariants_1.6.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/CrispRVariants
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CrispRVariants/
软件包下载报告	下载数据