DNABarcodes

DOI:10.18129 / B9.bioc.DNABarcodes

用于创建和分析下一代测序多路复用实验中使用的DNA条形码的工具

Bioconductor版本:Release (3.6)

该软件包提供了一个功能，以创建能够纠正插入，删除和替换错误的DNA条形码集。现有的条形码可以根据条形码之间的最小、最大和平均距离进行分析。最后，以(可能发生突变的)条形码开始的读取可以被解复用，即分配给它们的原始参考条形码。

作者:Tilo Buschmann < Tilo . Buschmann。Ac在gmail.com>

维护人员:Tilo Buschmann < Tilo . Buschmann。Ac在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("DNABarcodes")

文档

超文本标记语言	R脚本	DNABarcodes
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	预处理，测序，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	矩阵、并行
进口	Rcpp(> = 0.11.2),黑洞
链接	Rcpp，黑洞
建议	knitr，BiocStyle，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	DNABarcodes_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	DNABarcodes_1.8.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DNABarcodes_1.8.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/DNABarcodes
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DNABarcodes/
软件包下载报告	下载数据