DRIMSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.DRIMSeq

RNA-seq中差异转录本的使用及dirichlet -多项式模型的tuQTL分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

该包提供了两个框架。一个用于不同条件下的差异转录物使用分析，一个用于tuQTL分析。两者都是基于用dirichlet多项分布对基因组特征(即转录本)的计数进行建模。该包还提供了数据和结果的可视化和探索功能。

作者:Malgorzata Nowicka [aut, cre]

维护者:Malgorzata Nowicka

安装

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PDF	R脚本	利用DRIMSeq软件包对RNA-seq进行差异转录本使用和转录本使用QTL分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing，DifferentialExpression，DifferentialSplicing，GeneExpression，遗传学，MultipleComparison，RNASeq，单核苷酸多态性，测序，软件，WorkflowStep
版本	1.6.0
在Bioconductor中	BioC 3.3 (R-3.3)(2年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于	R (>= 3.4.0)
进口	跑龙套,统计数据,质量，GenomicRanges，IRanges，S4Vectors，BiocGenerics、方法、BiocParallel，limma，刨边机，ggplot2，reshape2
链接
建议	PasillaTranscriptExpr，GeuvadisTranscriptExpr、网格BiocStyle，knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我	IsoformSwitchAnalyzeR
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	DRIMSeq_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	DRIMSeq_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DRIMSeq_1.6.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/DRIMSeq
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DRIMSeq/
软件包下载报告	下载数据