GSEABase

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSEABase

基因集富集数据结构与方法

Bioconductor版本:Release (3.6)

这个包提供了支持基因集富集分析(GSEA)的类和方法。

作者:马丁·摩根，赛斯·法尔肯，罗伯特·绅士

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("GSEABase")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“GSEABase”)

PDF	R脚本	GSEABase的介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	去，GeneExpression，GeneSetEnrichment，GraphAndNetwork，KEGG，软件
版本	1.40.1
Bioconductor自	BioC 2.1 (R-2.6)(10.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.6.0),BiocGenerics(> = 0.13.8),Biobase(> = 2.17.8),注释(> = 1.45.3)、方法图(> = 1.37.2)
进口	AnnotationDbi，XML
链接
建议	hgu95av2.db，GO.db，org.Hs.eg.db，Rgraphviz，ReportingTools，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	AGDEX，BicARE，CCPROMISE，cpvSNP，gCMAP，GRridge，GSVAdata，npGSEA，承诺，splineTimeR
进口我	AUCell，癌症，类别，categoryCompare，cellHTS2，EnrichmentBrowser，gCMAPWeb，GISPA，GSRI，GSVA，HTSanalyzeR，MIGSA，mogsa，oppar，PCpheno，phenoTest，帖子，承诺，ReportingTools，激流回旋
建议我	BiocCaseStudies，BioCor，clusterProfiler，计，GlobalAncova，globaltest，GOstats，GSAR，GSEAlm，桅杆，PGSEA，phenoTest
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	GSEABase_1.40.1.tar.gz
Windows二进制	GSEABase_1.40.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	GSEABase_1.40.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSEABase
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GSEABase/
包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档