GenVisR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenVisR

基因组可视化R

Bioconductor版本:Release (3.6)

主要在队列水平上为基因组数据制作高度可定制的出版质量图形。

作者:Zachary Skidmore [aut, cre]， Alex Wagner [aut]， Robert Lesurf [aut]， Katie Campbell [aut]， Jason Kunisaki [aut]， Obi Griffith [aut]， Malachi Griffith [aut]

维护者:Zachary Skidmore

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“GenVisR”)

文档

超文本标记语言	R脚本	GenVisR:介绍
超文本标记语言	R脚本	瀑布:功能介绍
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	分类，DNASeq，DataRepresentation，基础设施，软件
版本	1.8.1
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(2年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (>= 3.3.0)
进口	AnnotationDbi，biomaRt，BiocGenerics，Biostrings，DBI，FField，GenomicFeatures，GenomicRanges(> = 1.25.4),ggplot2(>= 2.1.0)， grid，gridExtra，gtable，gtools，IRanges(> = 2.7.5),plyr(> = 1.8.3),reshape2，Rsamtools，尺度，统计，utils，冬青
链接
建议	BiocStyle，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，knitr，RMySQL，roxygen2，testthat，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/griffithlab/GenVisR/issues
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进口我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	GenVisR_1.8.1.tar.gz
Windows二进制	GenVisR_1.8.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	GenVisR_1.8.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenVisR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GenVisR/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档