GenomicTuples

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenomicTuples

基因组元组的表示与操作

Bioconductor版本:Release (3.6)

GenomicTuples定义了用于存储基因组元组的通用容器。它旨在为基因组坐标元组提供功能,类似于genomic icranges Bioconductor包中用于基因组范围的功能。

作者:Peter Hickey < Peter。Hickey在gmail.com>,with contributions from Marcin Cieslik and Herve Pages.

维护者:Peter Hickey < Peter。Hickey在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“GenomicTuples”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“基因组元组”)

文档

超文本标记语言 R脚本 GenomicTuplesIntroduction
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataRepresentation基础设施测序软件
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.3.0),GenomicRanges(> = 1.23.15),GenomeInfoDb(> = 1.7.2),S4Vectors(> = 0.9.38)
进口 方法,BiocGenerics(> = 0.17.0),Rcpp(> = 0.11.2),IRanges(> = 2.5.26),data.table
链接 Rcpp
建议 testthatknitrBiocStylermarkdown
SystemRequirements
增强了
URL www.github.com/PeteHaitch/GenomicTuples
BugReports https://github.com/PeteHaitch/GenomicTuples/issues
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 GenomicTuples_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 GenomicTuples_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) GenomicTuples_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenomicTuples
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/GenomicTuples/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: