HTqPCR

DOI:10.18129 / B9.bioc.HTqPCR

自动分析高通量qPCR数据

Bioconductor版本:Release (3.6)

多条件或重复的高通量实时定量PCR (qPCR)检测Ct值分析。输入数据可以来自空间定义的格式，如ABI TaqMan低密度数组或OpenArray;Roche应用科学公司的LightCycler;Bio-Rad实验室的CFX板;传统的96或384孔板;或微流体设备，如Fluidigm公司的动态阵列。HTqPCR处理数据加载、质量评估、归一化、可视化以及特征(如基因、microRNAs)之间Ct值统计显著性的参数或非参数检验。

作者:Heidi Dvinge, Paul Bertone

维护者:Heidi Dvinge

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("HTqPCR")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“HTqPCR”)

PDF	R脚本	R
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，DifferentialExpression，GeneExpression，MicrotitrePlateAssay，MultipleComparison，预处理，质量控制，软件，可视化，qPCR
版本	1.32.0
在Bioconductor公司	BioC 2.5 (R-2.10)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase，RColorBrewer，limma
进口	affy，Biobase，gplots，图形，grDevices，limma、方法、RColorBrewer， stats, stats4, utils
链接
建议	statmod
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.ebi.ac.uk/bertone/software
全靠我
进口我	nondetects，unifiedWMWqPCR
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	HTqPCR_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	HTqPCR_1.32.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	HTqPCR_1.32.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/HTqPCR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/HTqPCR/
软件包下载报告	下载数据