HelloRanges

DOI:10.18129 / B9.bioc.HelloRanges

向床具使用者介绍*系列产品

Bioconductor版本:Release (3.6)

将bedtools命令行调用转换为来自Bioconductor *Ranges基础架构的R代码调用函数。这是为了教育新手Bioconductor用户,并比较两个框架的语法和语义。

作者:迈克尔·劳伦斯

维护者:Michael Lawrence

引用(来自R,输入引用(“HelloRanges”)):

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##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("HelloRanges")

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PDF R脚本 HelloRanges教程
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文本 新闻

细节

biocViews 注释报道DataImportGenomeAnnotationSequenceMatching测序软件VariantAnnotation
版本 1.4.0
在Bioconductor中 BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 方法,BiocGenericsS4Vectors(> = 0.11.6),IRanges(> = 2.11.8),GenomicRanges(> = 1.29.6),Biostrings(> = 2.41.3),BSgenomeGenomicFeaturesVariantAnnotation(> = 1.19.3),RsamtoolsGenomicAlignmentsrtracklayer(> = 1.33.8),GenomeInfoDbSummarizedExperiment
进口 docopt,统计,工具,实用程序
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源包 HelloRanges_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 HelloRanges_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) HelloRanges_1.4.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/HelloRanges
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/HelloRanges/
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