Bioconductor版本:Release (3.6)
将bedtools命令行调用转换为来自Bioconductor *Ranges基础架构的R代码调用函数。这是为了教育新手Bioconductor用户,并比较两个框架的语法和语义。
作者:迈克尔·劳伦斯
维护者:Michael Lawrence
引用(来自R,输入引用(“HelloRanges”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("HelloRanges")
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“HelloRanges”)
R脚本 | HelloRanges教程 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,报道,DataImport,GenomeAnnotation,SequenceMatching,测序,软件,VariantAnnotation |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor中 | BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | 方法,BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.11.6),IRanges(> = 2.11.8),GenomicRanges(> = 1.29.6),Biostrings(> = 2.41.3),BSgenome,GenomicFeatures,VariantAnnotation(> = 1.19.3),Rsamtools,GenomicAlignments,rtracklayer(> = 1.33.8),GenomeInfoDb,SummarizedExperiment |
进口 | docopt,统计,工具,实用程序 |
链接 | |
建议 | HelloRangesData,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | HelloRanges_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | HelloRanges_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | HelloRanges_1.4.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/HelloRanges |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/HelloRanges/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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