IPO
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doi：10.18129/b9.bioc.ipo
XCMS数据处理参数的自动优化
生物导体版本：版本（3.6）
XCMS数据处理的结果在很大程度上取决于参数设置。IPO（`iSotopologue参数优化“）是一种参数优化工具，适用于不同种类的样品和液相色谱法与高分辨率质谱设备耦合，快速且无标记步骤。IPO使用天然稳定的13C同位素来计算峰采摘分数。通过最小化特征内的相对保留时间差异，通过最大化分组参数来优化保留时间校正，通过最大化特征的数量来优化分组参数的数量，从每次注入汇总样品的每次注射中恰好一个峰。通过设计实验可以实现不同的参数设置。使用响应表面模型评估所得的分数。
作者：gunnar libiseller
维护者：托马斯·里本鲍尔（Thomas Riebenbauer
引用（从r内，输入引用（“ IPO”））：
安装
要安装此软件包，请启动R并输入：
##尝试http：//如果不支持https：// URL不支持源（“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”）bioclite（“ ipo”）
文档
| html | R脚本 | IPO的XCMS参数优化 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 质谱，，，，代谢组学，，，，软件 |
| 版本 | 1.4.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.4（R-3.3）（1。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） +文件许可证 |
| 要看 | XCMS（> = 1.50.0），RSM，，，，相机，grdevices，图形，统计，utils |
| 进口 | 生物比较 |
| 链接 | |
| 建议 | 运行，，，，生物基因，，，，MSDATA，，，，mtbls2，，，，法阿科，，，，尼特 |
| 系统要求 | |
| 增强 | 平行 |
| URL | https://github.com/rietho/ipo |
| BugReports | https://github.com/rietho/ipo/issues/new |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | ipo_1.4.1.tar.gz |
| Windows二进制 | ipo_1.4.1.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | ipo_1.4.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ipo |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/ipo/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
| Bioc 3.6的旧源软件包 | 来源存档 |
