生物导体版本:版本(3.6)
该软件包对RNA-seq数据(.bam Files)进行内含子外观保留分析。
作者:ali oghabian
维护者:Ali Oghabian
引用(从r内,输入引用(“利息”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url source(“ https://www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“利息”)
html | R脚本 | 兴趣,内含子外显子保留估计器 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 结盟,,,,替代方案,,,,覆盖范围,,,,差异性,,,,差速器,,,,正常化,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.2.2 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(1年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | r(> = 3.4),基因组机,,,,rsamtools,,,,总结性特征,,,,EDGER,,,,S4VECTORS |
进口 | seqlogo,,,,生物弦,,,,GenomicFeatures,,,,iranges,,,,seqinr,图形,grdevices,Stats,Utils,网格,方法,DBI,,,,rmysql,,,,基因组签名,,,,生物比较,,,,生物基因,,,,dexseq,,,,deseq2 |
链接 | |
建议 | Clinfun,,,,尼特,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ivey_1.2.2.2.tar.gz |
Windows二进制 | 兴趣_1.2.2.2.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | 兴趣_1.2.2.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/interest |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/interest/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
Bioc 3.6的旧源软件包 | 来源存档 |