兴趣

doi:10.18129/b9.bioc.interest

内含子 - 外观保留估计器

生物导体版本:版本(3.6)

该软件包对RNA-seq数据(.bam Files)进行内含子外观保留分析。

作者:ali oghabian ,dario greco ,mikko frilander frilander>

维护者:Ali Oghabian ,Mikko Frilander

引用(从r内,输入引用(“利息”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url source(“ https://www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“利息”)

文档

html R脚本 兴趣,内含子外显子保留估计器
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 结盟,,,,替代方案,,,,覆盖范围,,,,差异性,,,,差速器,,,,正常化,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件
版本 1.2.2
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(1年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.4),基因组机,,,,rsamtools,,,,总结性特征,,,,EDGER,,,,S4VECTORS
进口 seqlogo,,,,生物弦,,,,GenomicFeatures,,,,iranges,,,,seqinr,图形,grdevices,Stats,Utils,网格,方法,DBI,,,,rmysql,,,,基因组签名,,,,生物比较,,,,生物基因,,,,dexseq,,,,deseq2
链接
建议 Clinfun,,,,尼特,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ivey_1.2.2.2.tar.gz
Windows二进制 兴趣_1.2.2.2.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) 兴趣_1.2.2.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/interest
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/interest/
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