萝拉

DOI:10.18129 / B9.bioc.LOLA

位点重叠分析富集基因组范围

Bioconductor版本:Release (3.6)

提供与公共和自定义区域集(基因组范围)数据库测试基因组区域集重叠的功能。这使得对基因组区域集进行自动化富集分析成为可能，从而促进了功能基因组学和表观基因组学数据的解释。

作者:Nathan Sheffield [aut, cre]， Christoph Bock [cre]

维护者:Nathan Sheffield < Nathan at code.databio.org>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“LOLA”)

文档

超文本标记语言	R脚本	选择LOLA宇宙
超文本标记语言	R脚本	从LOLA开始
超文本标记语言	R脚本	使用LOLA核心
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文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，FunctionalGenomics，GeneRegulation，GeneSetEnrichment，GenomeAnnotation，MethylSeq，测序，软件，SystemsBiology
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，data.table，reshape2， utils，统计
链接
建议	knitr平行,testthat，BiocStyle，rmarkdown
SystemRequirements
增强了	simpleCache，qvalue，ggplot2
URL	http://databio.org/lola
BugReports	http://github.com/nsheff/LOLA
全靠我
进口我
建议我	位深蓝
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	LOLA_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	LOLA_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	LOLA_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LOLA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/LOLA/
软件包下载报告	下载数据