桅杆

DOI:10.18129 / B9.bioc.MAST

基于模型的单细胞转录组学分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

处理零膨胀单细胞实验数据的方法和模型。

作者:Andrew McDavid [aut, cre]， Greg Finak [aut]， Masanao Yajima [aut]

维护者:Andrew McDavid

安装

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文档

超文本标记语言	R脚本	MAST简介
超文本标记语言	R脚本	利用MAST在MAIT细胞中进行筛选、差异表达和基因集富集
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文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，GeneSetEnrichment，RNASeq，SingleCell，软件，转录组
版本	1.4.1
Bioconductor自	BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	SummarizedExperiment(>= 1.5.3)， r (>= 3.4)
进口	Biobase，BiocGenerics，S4Vectors，data.table，ggplot2，plyr，stringr，abind、方法、并行reshape2， stats, stats4, graphics, utils
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat，lme4(> = 1.0),roxygen2(> 4.0.0),numDeriv，车，gdata，晶格，GGally，GSEABase，NMF，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，rsvd，limma，RColorBrewer，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RGLab/MAST/
BugReports	https://github.com/RGLab/MAST/issues
取决于我
进口我
建议我	clusterExperiment
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	MAST_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	MAST_1.4.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MAST_1.4.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MAST
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MAST/
包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档