mbt

DOI:10.18129 / B9.bioc.MBttest

多重Beta t检验

Bioconductor版本:Release (3.6)

MBttest方法由Baggerly et al .(2003)的beta t检验方法发展而来。与baySeq (Hard castle and Kelly 2010)、DESeq (Anders and Huber 2010)和exact test (Robinson and Smyth 2007、2008)以及McCarthy et al .(2012)的GLM相比，MBttest工作效率高，即功率大、FDR估计保守性高、稳定性好。MBttest适用于转录组数据、标签数据、SAGE数据(计数数据)，这些数据来自小样本或几个复制库。它可以用来鉴定基因、mRNA异构体或标签在两种情况下的差异表达。

作者:谭元德

维护者:谭元德<谭元德at gmail.com>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("MBttest")

文档

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browseVignettes (mbt)

PDF	R脚本	使用“MBttest”包分析RNA-Seq计数数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing，报道，DifferentialExpression，DifferentialSplicing，GeneExpression，MultipleComparison，圣人，测序，软件，转录
版本	1.5.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.3.0)， stats，gplots，gtools、图形、基础、utils、grDevices
进口
链接
建议	BiocStyle，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	MBttest_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	MBttest_1.5.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MBttest_1.5.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/MBttest
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MBttest/
软件包下载报告	下载数据