MIGSA

DOI:10.18129 / B9.bioc.MIGSA

海量整合基因集分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

海量整合基因集分析。MIGSA包允许对多个表达和基因集同时执行大规模和综合的基因集分析。它提供了一个通用的基因表达分析框架，提供了全面和连贯的分析。只需要一个最小的用户参数设置，就可以通过最佳的可用方法，即dEnricher和mgszs，以综合的方式进行奇异和基因集富集分析。这个大型组学数据工具的最大优势是它提供了几个功能来探索、分析和可视化其结果，以便于在巨大的信息源上进行数据挖掘任务。MIGSA包还提供了几个功能，允许从多个库轻松加载最新的基因集。

作者:Juan C. Rodriguez, Cristobal Fresno, Andrea S. Llera和Elmer A. Fernandez

维护者:Juan C. Rodriguez

安装

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PDF	R脚本	TCGA获得数据集
PDF	R脚本	海量整合基因集分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GeneSetEnrichment，KEGG，微阵列，RNASeq，软件，可视化
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (R-3.4)(1年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(>= 3.4)，方法，BiocGenerics
进口	AnnotationDbi，Biobase，BiocParallel，data.table，刨边机，futile.logger，ggdendro，ggplot2，GO.db，GOstats，图、图形、grDevices、网格、GSEABase，limma，matrixStats，mGSZ，org.Hs.eg.db，RBGL，reshape2，Rgraphviz，RJSONIO,统计,跑龙套,素食主义者
链接
建议	breastCancerMAINZ，breastCancerNKI，breastCancerTRANSBIG，breastCancerUNT，breastCancerUPP，breastCancerVDX，pbcmc，MIGSAdata
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bdmg.com.ar/
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	MIGSA_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	MIGSA_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MIGSA_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MIGSA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MIGSA/
包下载报告	下载数据