米拉

DOI:10.18129 / B9.bioc.MIRA

甲基化调控活性的推断

Bioconductor版本:Release (3.6)

MIRA测量感兴趣的调控位点(如转录因子结合位点)周围甲基化水平的“下降”程度，用于整个基因组中该类型位点的实例，然后用于推断调控活性。

作者:Nathan Sheffield [aut]， Christoph Bock [ctb]， John Lawson [aut, cre]

维护者:John Lawson

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文档

超文本标记语言	R脚本	MIRA在生物学问题中的应用
超文本标记语言	R脚本	以甲基化为基础的调控活性推断
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细节

biocViews	ChIPSeq，报道，DNAMethylation，表观遗传学，FunctionalGenomics，GeneRegulation，GenomeAnnotation，MethylSeq，测序，软件，SystemsBiology
版本	1.0.1
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4)
进口	BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，data.table，ggplot2，Biobase统计数据,bsseq、方法
链接
建议	knitr平行,testthat，BiocStyle，rmarkdown
SystemRequirements
增强了	simpleCache
URL	http://databio.org/mira
BugReports	https://github.com/databio/MIRA
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包档案

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源包	MIRA_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	MIRA_1.0.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MIRA_1.0.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MIRA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MIRA/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档