MatrixRider

DOI:10.18129 / B9.bioc.MatrixRider

获得给定序列上结合位点矩阵的总亲和度和占用率

Bioconductor版本:Release (3.6)

计算整个序列的单个数字，反映DNA结合蛋白与其相互作用的倾向。DNA结合蛋白必须用PFM矩阵来描述，例如从Jaspar得到的PFM矩阵。

作者:Elena Grassi

维护者:Elena Grassi < Grassi。E在gmail.com>

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PDF	R脚本	完全的亲和和占有
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation，遗传学，MotifAnnotation，软件
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.1.2)
进口	方法,TFBSTools，IRanges，XVector，Biostrings
链接	IRanges，XVector，Biostrings，S4Vectors
建议	RUnit，BiocGenerics，BiocStyle，JASPAR2014
SystemRequirements
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	MatrixRider_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	MatrixRider_1.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MatrixRider_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MatrixRider
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MatrixRider/
软件包下载报告	下载数据