MetaboSignal

DOI:10.18129 / B9.bioc.MetaboSignal

代谢信号:一个基于网络的方法覆盖和探索代谢和信号通路KEGG

Bioconductor版本:Release (3.6)

MetaboSignal是一个R包，允许合并，分析和定制代谢和信号KEGG途径。这是一种基于网络的方法，旨在探索基因(信号或酶基因)和代谢物之间的拓扑关系，是研究代谢表型的遗传景观和调控网络的有力工具。

作者:Andrea Rodriguez-Martinez, Rafael Ayala, Joram M. Posma, Ana L. Neves, Maryam Anwar, Jeremy K. Nicholson, Marc-Emmanuel Dumas

维护者:Andrea Rodriguez-Martinez < Andrea。Rodriguez-martinez13在imperial.ac。英国b>，拉斐尔·阿亚拉

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("MetaboSignal")

文档

超文本标记语言	R脚本	MetaboSignal
超文本标记语言	R脚本	代谢信号2:合并KEGG与额外的交互资源
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneSignaling，GeneTarget，GraphAndNetwork，KEGG，网络，通路，Reactome，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor中	BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.3)
进口	KEGGgraph，hpar，igraph，RCurl，KEGGREST，EnsDb.Hsapiens.v75，统计，图形，实用程序，org.Hs.eg.db，biomaRt，AnnotationDbi，MWASTools，mygene
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，knitr，BiocStyle，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
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这取决于我
进口我
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	MetaboSignal_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	MetaboSignal_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MetaboSignal_1.8.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/MetaboSignal
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MetaboSignal/
软件包下载报告	下载数据