NanoStringDiff

DOI:10.18129 / B9.bioc.NanoStringDiff

纳米串nCounter数据的差分表达式分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

这个包利用负二项族的广义线性模型(GLM)来描述计数数据，并允许多因素设计。NanoStrongDiff在模型框架中结合了尺寸因子(由正控制和管家控制计算得到)和背景层(由负控制获得)，从而充分利用了NanoString nCounter Analyzer提供的所有归一化信息。

作者:hong wang ，tingting zhai , chi wang

维护者:婷婷翟<婷婷。翟在uky.edu>，hong wang

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http:// if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("NanoStringDiff")

文档

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browseVignettes(“NanoStringDiff”)

PDF	R脚本	NanoStringDiff装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，归一化，软件
版本	1.9.2
在Bioconductor公司	BioC 3.2 (R-3.2)(2.5年)
许可证	GPL
取决于	Biobase
进口	matrixStats、方法、Rcpp
链接	Rcpp
建议	testthat，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	NanoStringDiff_1.9.2.tar.gz
Windows二进制	NanoStringDiff_1.9.2.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	NanoStringDiff_1.9.2.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/NanoStringDiff
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/NanoStringDiff/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档