Organism.dplyr

DOI:10.18129 / B9.bioc.Organism.dplyr

基于dplyr的生物导体注释资源访问

Bioconductor版本:Release (3.6)

该包提供了Bioconductor“注释”资源的替代接口，特别是“org”包(例如，org. hs .eg.db)的基因标识符映射功能和“TxDb”包(例如，TxDb. hsapiens . ucsc .hg38. knowngene)的基因组坐标功能。

作者:Martin Morgan [aut, cre]，程宇波[ctb]

维护者:马丁·摩根<马丁。在roswellpark.org>

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文档

超文本标记语言	R脚本	Organism.dplyr
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文本		新闻

细节

biocViews	注释，GenomeAnnotation，测序，软件
版本	1.6.2
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4)，dplyr(> = 0.7.0),AnnotationFilter(> = 1.1.3)
进口	RSQLite，S4Vectors，GenomeInfoDb，IRanges，GenomicRanges，GenomicFeatures，AnnotationDbi，方法，工具，utils，BiocFileCache，DBI，dbplyr
链接
建议	org.Hs.eg.db，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene，org.Mm.eg.db，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.ensGene，testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle，ggplot2
SystemRequirements
增强了
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	Organism.dplyr_1.6.2.tar.gz
Windows二进制	Organism.dplyr_1.6.2.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	Organism.dplyr_1.6.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Organism.dplyr
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Organism.dplyr/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档