PAA

DOI:10.18129 / B9.bioc.PAA

PAA(蛋白质阵列分析仪)

Bioconductor版本:Release (3.6)

PAA导入单色(蛋白质)微阵列数据，该数据已保存在gpr文件格式-特别是ProtoArray数据。预处理(背景校正、批过滤、归一化)后，进行单变量特征预选(例如，使用“最小M统计量”方法-以下简称“mm”)。随后，进行多元特征选择以发现候选生物标志物。因此，可以使用基于频率的向后消除方法或集成特征选择。PAA提供了一个完整的分析工具工具箱，包括用于结果检查和评估的几种不同的图。

作者:Michael Turewicz [aut, cre]， Martin Eisenacher [ctb, cre]

维护者:Michael Turewicz < Michael。tuturewicz at rub.de>， Martin Eisenacher < Martin。Eisenacher在rub.de>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“PAA”)

文档

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PDF	R脚本	PAA教程
PDF		PAA_1.7.1.pdf
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	分类，微阵列，OneChannel，蛋白质组学，软件
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(3.5年)
许可证	BSD_3_clause + file LICENSE
取决于	R (>= 3.2.0)，Rcpp(> = 0.11.6)
进口	e1071，gplots，gtools，limma，质量，mRMRe，randomForest，ROCR，股东价值分析
链接	Rcpp
建议	BiocStyle，RUnit，BiocGenerics，vsn
SystemRequirements	c++软件包随机丛林
增强了
URL	http://www.ruhr-uni-bochum.de/mpc/software/PAA/
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	PAA_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	PAA_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	PAA_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PAA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/PAA/
软件包下载报告	下载数据