Bioconductor版本:Release (3.6)
这个包实现了一种通用的基因集分析方法,称为PADOG,它淡化了在要分析的基因集中经常出现的基因的重要性。该软件包还提供了基因集分析方法的敏感性和排名基准,使用KEGGdzPathwaysGEO软件包中的24个公共数据集。
作者:Adi Laurentiu Tarca
维护者:Adi Laurentiu Tarca
引文(从R内,输入引用(“PADOG”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“PADOG”)
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browseVignettes(“PADOG”)
R脚本 | PADOG | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,OneChannel,软件,TwoChannel |
版本 | 1.20.0 |
在Bioconductor | BioC 2.11 (R-2.15)(5.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 3.0.0),KEGGdzPathwaysGEO、方法、Biobase |
进口 | limma,AnnotationDbi,GSA,foreach,doRNG,hgu133plus2.db,hgu133a.db,KEGG.db,nlme |
链接 | |
建议 | doParallel、并行 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | BLMA |
进口我 | EGSEA |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | PADOG_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | PADOG_1.20.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | PADOG_1.20.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PADOG |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/PADOG/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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