RCy3

DOI:10.18129 / B9.bioc.RCy3

在Cytoscape > = 3.3.0显示和操作图

Bioconductor版本:版本(3.6)

Vizualize、分析和探索图形、连接R Cytoscape (> = 3.3.0)。

作者:挚友Muetze,格奥尔基Kolishovski,保罗·香农

维护人员:挚友Muetze <挚友。muetze14 alumni.imperial.ac。英国>,格奥尔基Kolishovski < g_kolishv yahoo.com >、保罗·香农< pshannon systemsbiology.org >

从内部引用(R,回车引用(“RCy3”)):

安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“RCy3”)

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PDF R脚本 RCy3概述
PDF 参考手册
文本 自述
文本 新闻

细节

biocViews GraphAndNetwork,网络,软件,ThirdPartyClient,可视化
版本 1.8.0
Bioconductor自 BioC 3.2 (r - 3.2)(2.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.2),(> = 1.48.0)
进口 httr、方法、RCurl,RJSONIO
链接
建议 BiocGenerics,RUnit,knitr,igraph,RColorBrewer,paxtoolsr,rmarkdown
SystemRequirements Cytoscape(> = 3.3.0),老年痴呆(> = 3.3.7),Java (> = 8)
增强了
URL https://github.com/tmuetze/Bioconductor_RCy3_the_new_RCytoscape
BugReports https://github.com/tmuetze/Bioconductor_RCy3_the_new_RCytoscape/issues
取决于我
进口我 categoryCompare,NCIgraph
建议我 石墨
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包 RCy3_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 RCy3_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) RCy3_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RCy3
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/RCy3/
包下载报告 下载数据

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