Bioconductor版本:Release (3.6)
从数据库中检索用于注释、可视化和集成发现(DAVID)的工具,使用Web服务将数据检索到R对象中。该软件包提供了DAVID网站的主要功能,包括:i)用户友好连接上传基因/背景列表,更改基因/背景位置,选择当前物种/s,选择注释等ii)提交的基因列表报告,注释类别摘要,基因/术语聚类,功能注释图,功能注释表
作者:克里斯托巴尔·弗雷斯诺和埃尔默·a·费尔南德斯
维护者:Cristobal Fresno
引用(从R中,输入引用(“RDAVIDWebService”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("RDAVIDWebService")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“RDAVIDWebService”)
R脚本 | RDAVIDWebService:一个面向DAVID的多功能R接口 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GraphAndNetwork,软件,可视化 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 2.13 (R-3.0)(4.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R(>= 2.14.1),方法,图,GOstats,ggplot2 |
进口 | 类别,GO.db,RBGL,rJava |
链接 | |
建议 | Rgraphviz |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.bdmg.com.arhttp://david.abcc.ncifcrf.gov/ |
全靠我 | CompGO |
进口我 | |
建议我 | FGNet,IntramiRExploreR |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | RDAVIDWebService_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | RDAVIDWebService_1.16.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | RDAVIDWebService_1.16.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/RDAVIDWebService |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/RDAVIDWebService/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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