RDAVIDWebService

DOI:10.18129 / B9.bioc.RDAVIDWebService

一个R包,用于使用Web服务API从DAVID检索数据到R对象。

Bioconductor版本:Release (3.6)

从数据库中检索用于注释、可视化和集成发现(DAVID)的工具,使用Web服务将数据检索到R对象中。该软件包提供了DAVID网站的主要功能,包括:i)用户友好连接上传基因/背景列表,更改基因/背景位置,选择当前物种/s,选择注释等ii)提交的基因列表报告,注释类别摘要,基因/术语聚类,功能注释图,功能注释表

作者:克里斯托巴尔·弗雷斯诺和埃尔默·a·费尔南德斯

维护者:Cristobal Fresno

引用(从R中,输入引用(“RDAVIDWebService”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("RDAVIDWebService")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“RDAVIDWebService”)

PDF R脚本 RDAVIDWebService:一个面向DAVID的多功能R接口
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGraphAndNetwork软件可视化
版本 1.16.0
在Bioconductor公司 BioC 2.13 (R-3.0)(4.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R(>= 2.14.1),方法,GOstatsggplot2
进口 类别GO.dbRBGLrJava
链接
建议 Rgraphviz
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bdmg.com.arhttp://david.abcc.ncifcrf.gov/
全靠我 CompGO
进口我
建议我 FGNetIntramiRExploreR
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 RDAVIDWebService_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 RDAVIDWebService_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) RDAVIDWebService_1.16.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/RDAVIDWebService
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/RDAVIDWebService/
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