RaggedExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.RaggedExperiment

跨样本的稀疏实验和分析的表示

Bioconductor版本:Release (3.6)

这个包提供了拷贝数、突变和其他数据的灵活表示,这些数据适合基因组位置数据的不规则数组模式。这些数据的基本表示形式为用户提供了一个矩形平面界面,在行中显示范围信息,在列中显示样本/标本。

作者:马丁·摩根[aut, cre],马塞尔·拉莫斯[aut]

维护者:马丁·摩根<马丁。在roswellpark.org>

引文(从R内,输入引用(“RaggedExperiment”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“raggeexperiment”)

文档

超文本标记语言 R脚本 RaggedExperiment
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataRepresentation基础设施软件
版本 1.2.5
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(1年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.4.0),GenomicRanges
进口 BiocGenericsIRanges、方法、S4Vectors统计数据,SummarizedExperiment
链接
建议 knitrtestthatMultiAssayExperiment
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/Bioconductor/RaggedExperiment/issues
全靠我
进口我 RTCGAToolbox
建议我 MultiAssayExperiment
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 RaggedExperiment_1.2.5.tar.gz
Windows二进制 RaggedExperiment_1.2.5.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) RaggedExperiment_1.2.5.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RaggedExperiment
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/RaggedExperiment/
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