ReactomePA

DOI:10.18129 / B9.bioc.ReactomePA

反应组通路分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

该包提供了基于REACTOME路径数据库的路径分析功能。它实现了富集分析、基因集富集分析和一些可视化功能。

作者:于广创[aut, cre]， Vladislav Petyuk [ctb]

维护人员:guangchuangyu

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“ReactomePA”)

文档

超文本标记语言	R脚本	一个用于反应组路径分析的R包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，GeneSetEnrichment，MultipleComparison，通路，Reactome，软件，可视化
版本	1.22.0
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(6年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.3.1)，剂量(> = 3.0.0)
进口	AnnotationDbi，reactome.db，igraph，石墨
链接
建议	BiocStyle，clusterProfiler，knitr，org.Hs.eg.db，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://guangchuangyu.github.io/ReactomePA
BugReports	https://github.com/GuangchuangYu/ReactomePA/issues
全靠我
进口我	bioCancer，林肯，miRsponge
建议我	ChIPseeker，CINdex，clusterProfiler
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	ReactomePA_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	ReactomePA_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ReactomePA_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ReactomePA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ReactomePA/
软件包下载报告	下载数据