Rqc

DOI:10.18129 / B9.bioc.Rqc

高通量测序数据质量控制工具

Bioconductor版本:Release (3.6)

Rqc是一种优化的工具,设计用于高通量测序数据的质量控制和评估。它对整个文件进行并行处理,并生成包含一组高分辨率图形的报告。

作者:Welliton Souza, Benilton Carvalho

维护:Welliton Souza

引用(从R中,输入引用(“Rqc”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("Rqc")

文档

超文本标记语言 R脚本 使用Rqc
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文本 新闻

细节

biocViews DataImport质量控制测序软件
版本 1.12.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (R-3.1)(3.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 BiocParallelShortReadggplot2
进口 BiocGenericsBiostringsIRanges、方法、S4Vectorsknitr(> = 1.7),BiocStyleplyr减价、网格reshape2消化Rcpp(> = 0.11.6),biovizBase闪亮的RsamtoolsGenomicAlignmentsGenomicFiles
链接 Rcpp
建议 testthat
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/labbcb/Rqc
BugReports https://github.com/labbcb/Rqc/issues
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 Rqc_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 Rqc_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) Rqc_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rqc
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/Rqc/
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