Bioconductor版本:Release (3.6)
Rqc是一种优化的工具,设计用于高通量测序数据的质量控制和评估。它对整个文件进行并行处理,并生成包含一组高分辨率图形的报告。
作者:Welliton Souza, Benilton Carvalho
维护:Welliton Souza
引用(从R中,输入引用(“Rqc”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("Rqc")
超文本标记语言 | R脚本 | 使用Rqc |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,质量控制,测序,软件 |
版本 | 1.12.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (R-3.1)(3.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | BiocParallel,ShortRead,ggplot2 |
进口 | BiocGenerics,Biostrings,IRanges、方法、S4Vectors,knitr(> = 1.7),BiocStyle,plyr,减价、网格reshape2,消化,Rcpp(> = 0.11.6),biovizBase,闪亮的,Rsamtools,GenomicAlignments,GenomicFiles |
链接 | Rcpp |
建议 | testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/labbcb/Rqc |
BugReports | https://github.com/labbcb/Rqc/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | Rqc_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | Rqc_1.12.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | Rqc_1.12.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rqc |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/Rqc/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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