SC3

DOI:10.18129 / B9.bioc.SC3

单细胞一致聚类

Bioconductor版本:Release (3.6)

单细胞RNA-Seq数据的无监督聚类和分析工具。

作者:Vladimir Kiselev

维护者:Vladimir Kiselev < Vladimir .yu。Kiselev在gmail.com>

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文档

超文本标记语言	R脚本	SC3包手册
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文本		新闻

细节

biocViews	分类，聚类，DataRepresentation，DifferentialExpression，DimensionReduction，GUI，RNASeq，SingleCell，软件，SupportVectorMachine，转录，转录组，可视化
版本	1.7.7
在Bioconductor中	BioC 3.3 (R-3.3)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.3)
进口	图形，统计，utils，方法，e1071平行,foreach，doParallel，doRNG，闪亮的，ggplot2，pheatmap(> = 1.0.8),ROCR，robustbase，rrcov，集群，WriteXLS，Rcpp(> = 0.11.1),SummarizedExperiment，SingleCellExperiment，BiocGenerics，S4Vectors
链接	Rcpp，RcppArmadillo
建议	knitr，rmarkdown，mclust，嘘
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/hemberg-lab/SC3
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/sc3/
这取决于我
进口我
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包档案

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源包	SC3_1.7.7.tar.gz
Windows二进制	SC3_1.7.7.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	SC3_1.7.7.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/SC3
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SC3/
软件包下载报告	下载数据
bioc3.6的旧源包	源存档