SRGnet

DOI:10.18129 / B9.bioc.SRGnet

SRGnet:一个R包，用于从转录组数据中研究基因突变的协同反应

Bioconductor版本:Release (3.6)

我们开发了SRGnet来分析转录组谱中的协同调节机制，这些机制可以增强细胞对突变、药物或环境暴露组合的整体反应。该软件包可用于识别协同反应基因下游的调控模块，优先考虑可能是潜在干预目标的协同调控基因，并将基因扰动实验置于背景下。

作者:Isar Nassiri [aut, cre]， Matthew McCall [aut, cre]

维护者:Isar Nassiri

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“SRGnet”)

文档

超文本标记语言		SRGnet一个从转录组学数据研究基因突变协同反应的R包\
PDF		参考手册

细节

biocViews	回归，软件，StatisticalMethod
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.3.1)，EBcoexpress，质量，igraph，pvclust(2.0 > = 0),“绿带运动”(> = 2.1.1),limma，DMwR(> = 0.4.1),matrixStats，Hmisc
进口
链接
建议	knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	SRGnet_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	SRGnet_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	SRGnet_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SRGnet
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SRGnet/
软件包下载报告	下载数据