SeqSQC

DOI:10.18129 / B9.bioc.SeqSQC

生物导体包样品质量检查与下一代测序数据

Bioconductor版本:Release (3.6)

SeqSQC旨在识别NGS数据中的问题样本，包括性别不匹配、污染、隐性相关性和种群异常值的样本。

作者:刘谦[aut, cre]

维护者:刘谦< qliu7@buffalo.edu >

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文档

超文本标记语言	R脚本	用SeqSQC检测下一代测序数据的样品质量
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文本		新闻

细节

biocViews	实验数据，基因组，Homo_sapiens_Data，Project1000genomes，测序数据，软件
版本	1．0．0
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4)，ExperimentHub(> = 1.3.7),SNPRelate(> = 1.10.2)
进口	e1071，GenomicRanges，gdsfmt，ggplot2，GGally，IRanges、方法、rbokeh，RColorBrewer，reshape2，rmarkdown，S4Vectors，统计，utils
链接
建议	BiocStyle，knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
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包档案

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源包	SeqSQC_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	SeqSQC_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	SeqSQC_1.0.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/SeqSQC
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SeqSQC/
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