TFARM

DOI:10.18129 / B9.bioc.TFARM

转录因子关联规则挖掘器

Bioconductor版本:Release (3.6)

它搜索转录因子与转录因子靶标的相关关联，在特定的基因组区域。它还允许评估关联规则中转录因子(和转录因子组合)的重要性指数分布。

作者:Liuba Nausicaa Martino, Alice Parodi, Gaia Ceddia, Piercesare Secchi, Stefano Campaner, Marco Masseroli

维护者:Liuba Nausicaa Martino

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("TFARM")

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“TFARM”)

PDF	R脚本	转录因子关联规则挖掘器
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BiologicalQuestion，基础设施，软件，StatisticalMethod，转录
版本	1.0.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4)
进口	arules，字段，GenomicRanges、图形、grDevices、stringr，方法，统计
链接
建议	plyr，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	TFARM_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	TFARM_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	TFARM_1.0.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/TFARM
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TFARM/
软件包下载报告	下载数据