TReNA

DOI:10.18129 / B9.bioc.TReNA

利用基因表达、先验、机器学习来拟合转录调节网络

Bioconductor版本:Release (3.6)

重建转录调控网络的方法，特别是在具有全基因组TF结合位点信息的物种中。

作者:Seth Ament < Seth。ament at systemsbiology.org>， Paul Shannon ， Matthew Richards < mrrichard at systemsbiology.org>

维护者:Matthew Richards < mrrichard at systemsbiology.org>

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文档

超文本标记语言	R脚本	TReNA简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	FeatureExtraction，GeneExpression，GeneRegulation，NetworkInference，回归，软件，SystemsBiology，转录
版本	0.99.10
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4.0)， utils，glmnet(> = 2.0.3)
进口	RSQLite，lassopv，randomForest，耀斑，vbsr，foreach，doParallel，RPostgreSQL、方法、DBI，GenomicRanges
链接
建议	RUnit，limma，plyr，knitr，BiocGenerics，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	TReNA_0.99.10.tar.gz
Windows二进制	TReNA_0.99.10.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	TReNA_0.99.10.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TReNA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TReNA/
软件包下载报告	下载数据