topaseq
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doi：10.18129/b9.bioc.topaseq
用于基于拓扑的RNASEQ数据的途径分析包
生物导体版本：版本（3.6）
实施七种用于基于拓扑的RNASEQ和微阵列数据的方法分析：SPIA，DEGRAPH，TOPOLOGYGSA，TAPPA，PRS，PWEA，PWEA和单个途径的可视化工具。
作者：伊万娜·伊纳托娃（Eva Budinska）
维护者：ivana ihnatova
引用（从r内，输入引用（“ topaseq”））：
安装
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文档
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| R脚本 | 用于基于拓扑的MicroAray和RNA-seq数据的R套件 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，基因表达，，，，GraphandNetwork，，，，微阵列，，，，NetworkEnrichment，，，，途径，，，，rnaseq，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.11.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（3.5岁） |
| 执照 | AGPL-3 |
| 要看 | 石墨（> = 1.16），Grbase，，，，图形，，，，Locfit，，，，rgraphviz |
| 进口 | r.utils， 方法，生物酶， 平行，EDGER，，，，deseq2，，，，总结性特征，，，，rbgl，，，，deseq，，，，字段，，，，林玛，，，，Deachertimos，，，，kegggraph，，，，qpgraph，，，，快船，，，，AnnotationDbi，，，，多帕尔 |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | 运行，，，，生物基因，，，，Gagedata，，，，degraph，，，，plotrix，，，，org.hs.eg.db |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | topaseq_1.11.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/topaseq |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/topaseq/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
