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- Bioconductor 3.6
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- XBSeq
XBSeq
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DOI:10.18129 / B9.bioc.XBSeq
测试RNA-seq数据的微分表达式
Bioconductor版本:版本(3.6)
XBSeq我们开发了一种新的算法,建立了一个统计模型基于假设观测信号是真实表达信号的卷积和测序的声音。映射读取non-exonic地区是测序的噪音,它遵循泊松分布。鉴于从RNA-seq数据可以衡量的观察和噪音信号,真实表达信号,假如由负二项分布,可以划定,因此差异表达基因的准确检测。
作者:刘远航
维护人员:远航刘< liuy12 uthscsa.edu >
从内部引用(R,回车引用(“XBSeq”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“XBSeq”)
文档
| HTML | R脚本 | 微分表达式和apa使用XBSeq包使用统计数据的分析 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression,ExperimentalDesign,RNASeq,测序,软件 |
| 版本 | 1.10.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(2.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 3) |
| 取决于 | DESeq2R (> = 3.3) |
| 进口 | pracma,matrixStats,locfit,ggplot2、方法、Biobase,dplyr,magrittr,咆哮 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,DESeq,rmarkdown,BiocStyle,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/Liuy12/XBSeq |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | XBSeq_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | XBSeq_1.10.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | XBSeq_1.10.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/XBSeq |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/XBSeq/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
| 老BioC 3.6源码包 | 源存档 |
