注释

DOI:10.18129 / B9.bioc.annotate

微阵列注释

Bioconductor版本:Release (3.6)

使用R环境进行注释。

作者:R. Gentleman

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内，输入引用(“注释”))：

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“注释”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“注释”)

PDF	R脚本	注释的概述
PDF	R脚本	GO基本用法
PDF	R脚本	获得HTML输出
PDF	R脚本	方法:利用染色体信息
PDF	R脚本	如何使用在线查询工具
PDF	R脚本	使用Affymetrix探测级别数据
PDF	R脚本	使用数据包
PDF	R脚本	使用同源包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，去，通路，软件
版本	1.56.2
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 13年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.10)，AnnotationDbi(> = 1.27.5),XML
进口	Biobase，DBI，xtable，图形，utils，统计，方法，BiocGenerics(> = 0.13.8),RCurl
链接
建议	hgu95av2.db，genefilter，Biostrings(> = 2.25.10),IRanges，rae230a.db，rae230aprobe，tkWidgets，GO.db，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，hom.Hs.inp.db，humanCHRLOC，Rgraphviz，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	ChromHeatMap，GeneAnswers，geneplotter，GOSim，GRridge，GSEABase，染色体组型，macat，MGFM，MineICA，MLInterfaces，Neve2006，PCpheno，phenoTest，PREDA，PREDAsampledata，RpsiXML，sampleClassifier，ScISI，SemDist
进口我	咖啡馆，类别，categoryCompare，cn，codelink，debrowser，DOQTL，DrugVsDisease，facopy，gCMAP，gCMAPWeb，GeneAnswers，genefilter，GlobalAncova，globaltest，GOstats，光民，methyAnalysis，methylumi，MGFR，mvGST，phenoTest，qpgraph，ReportingTools，ScISI，splicegear，systemPipeR，tigre
建议我	adme16cod.db，ag.db，ath1121501.db，BiocCaseStudies，BiocGenerics，biomaRt，bovine.db，canine.db，canine2.db，celegans.db，chicken.db，clariomdhumanprobeset.db，clariomdhumantranscriptcluster.db，clariomshumanhttranscriptcluster.db，clariomshumantranscriptcluster.db，clariomsmousehttranscriptcluster.db，clariomsmousetranscriptcluster.db，clariomsrathttranscriptcluster.db，clariomsrattranscriptcluster.db，drosgenome1.db，drosophila2.db，ecoli2.db，GenomicRanges，GGHumanMethCancerPanelv1.db，GlobalAncova，GSAR，GSEAlm，h10kcod.db，h20kcod.db，hcg110.db，hgfocus.db，hgu133a.db，hgu133a2.db，hgu133b.db，hgu133plus2.db，hgu219.db，hgu95a.db，hgu95av2.db，hgu95b.db，hgu95c.db，hgu95d.db，hgu95e.db，hguatlas13k.db，hgubeta7.db，hguDKFZ31.db，hgug4100a.db，hgug4101a.db，hgug4110b.db，hgug4111a.db，hgug4112a.db，hgug4845a.db，hguqiagenv3.db，hi16cod.db，hs25kresogen.db，Hs6UG171.db，HsAgilentDesign026652.db，hta20probeset.db，hta20transcriptcluster.db，hthgu133a.db，hthgu133b.db，hu35ksuba.db，hu35ksubb.db，hu35ksubc.db，hu35ksubd.db，hu6800.db，huex10stprobeset.db，huex10sttranscriptcluster.db，hugene10stprobeset.db，hugene10sttranscriptcluster.db，hugene11stprobeset.db，hugene11sttranscriptcluster.db，hugene20stprobeset.db，hugene20sttranscriptcluster.db，hugene21stprobeset.db，hugene21sttranscriptcluster.db，HuO22.db，hwgcod.db，IlluminaHumanMethylation27k.db，illuminaHumanv1.db，illuminaHumanv2.db，illuminaHumanv2BeadID.db，illuminaHumanv3.db，illuminaHumanv4.db，illuminaHumanWGDASLv3.db，illuminaHumanWGDASLv4.db，illuminaMousev1.db，illuminaMousev1p1.db，illuminaMousev2.db，illuminaRatv1.db，indac.db，JazaeriMetaData.db，LAPOINTE.db，lumiHumanAll.db，lumiMouseAll.db，lumiRatAll.db，m10kcod.db，m20kcod.db，maigesPack，metagenomeSeq，mgu74a.db，mgu74av2.db，mgu74b.db，mgu74bv2.db，mgu74c.db，mgu74cv2.db，mguatlas5k.db，mgug4104a.db，mgug4120a.db，mgug4121a.db，mgug4122a.db，mi16cod.db，miRBaseVersions.db，中长期规划，mm24kresogen.db，MmAgilentDesign026655.db，moe430a.db，moe430b.db，moex10stprobeset.db，moex10sttranscriptcluster.db，mogene10stprobeset.db，mogene10sttranscriptcluster.db，mogene11stprobeset.db，mogene11sttranscriptcluster.db，mogene20stprobeset.db，mogene20sttranscriptcluster.db，mogene21stprobeset.db，mogene21sttranscriptcluster.db，mouse4302.db，mouse430a2.db，mpedbarray.db，mta10probeset.db，mta10transcriptcluster.db，mu11ksuba.db，mu11ksubb.db，Mu15v1.db，mu19ksuba.db，mu19ksubb.db，mu19ksubc.db，Mu22v3.db，mwgcod.db，Norway981.db，nugohs1a520180.db，nugomm1a520177.db，oneChannelGUI，OperonHumanV3.db，org.Ag.eg.db，org.At.tair.db，org.Bt.eg.db，org.Ce.eg.db，org.Cf.eg.db，org.Dm.eg.db，org.Dr.eg.db，org.EcK12.eg.db，org.EcSakai.eg.db，org.Gg.eg.db，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，org.Mmu.eg.db，org.Pf.plasmo.db，org.Pt.eg.db，org.Rn.eg.db，org.Sc.sgd.db，org.Ss.eg.db，org.Xl.eg.db，PartheenMetaData.db，pcxn，pedbarrayv10.db，pedbarrayv9.db，POCRCannotation.db，porcine.db，彪马，r10kcod.db，rae230a.db，rae230b.db，raex10stprobeset.db，raex10sttranscriptcluster.db，ragene10stprobeset.db，ragene10sttranscriptcluster.db，ragene11stprobeset.db，ragene11sttranscriptcluster.db，ragene20stprobeset.db，ragene20sttranscriptcluster.db，ragene21stprobeset.db，ragene21sttranscriptcluster.db，rat2302.db，rgu34a.db，rgu34b.db，rgu34c.db，rguatlas4k.db，rgug4105a.db，rgug4130a.db，rgug4131a.db，ri16cod.db，RnAgilentDesign028282.db，RnBeads，rnu34.db，Roberts2005Annotation.db，rta10probeset.db，rta10transcriptcluster.db，rtu34.db，rwgcod.db，SHDZ.db，siggenes，SummarizedExperiment，u133x3p.db，xlaevis.db，yeast2.db，ygs98.db，zebrafish.db
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测在R会话中使用此包的说明。

源包	annotate_1.56.2.tar.gz
Windows二进制	annotate_1.56.2.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	annotate_1.56.2.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/annotate
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/annotate/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档