anota2seq

DOI:10.18129 / B9.bioc.anota2seq

一般适用的转录组范围内的翻译效率分析使用anota2seq

Bioconductor版本:Release (3.6)

anota2seq为通过RNA测序或dna微阵列量化的多聚体分析和核糖体分析研究(两个或两个以上的样本类)提供翻译效率分析和差异表达分析。多聚体分析和核糖体分析通常为两个RNA源生成数据;翻译mRNA和总mRNA。差异表达分析用于估计每个RNA源(即翻译mRNA或总mRNA)内的变化。对翻译效率的分析旨在识别导致蛋白质水平变化的翻译效率变化，而蛋白质水平变化不依赖于总mRNA水平(即转译mRNA的变化不依赖于总mRNA水平)或缓冲机制，这是一种调节翻译效率的机制，使蛋白质水平在总mRNA水平波动的情况下保持不变(即总mRNA的变化不依赖于转译mRNA水平)。Anota2seq应用偏方差分析和随机方差模型来完成这些任务。

作者:Christian Oertlin <基督徒。oertlin吻。se>， Julie Lorent < Julie。在ki.se lorent >，Ola Larsson

维护者:Christian Oertlin < Christian。oertlin吻。se>， Julie Lorent < Julie。在ki.se lorent >

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PDF	R脚本	一般适用的转录组范围内的翻译效率分析使用anota2seq
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文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect，DifferentialExpression，GeneExpression，GeneRegulation，GenomeWideAssociation，微阵列，归一化，RNASeq，回归，测序，软件
版本	1.0.1
许可证	GPL-3
取决于	R(>= 3.4.0)，方法
进口	乘，qvalue，limma，DESeq2，刨边机，RColorBrewer， grDevices，图形，统计，效用，SummarizedExperiment
链接
建议	BiocStyle，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	anota2seq_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	anota2seq_1.0.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	anota2seq_1.0.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/anota2seq
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/anota2seq/
包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档