birte

DOI:10.18129 / B9.bioc.birte

表达调控影响的贝叶斯推断

Bioconductor版本:Release (3.6)

mRNA分子的表达水平受不同过程的调控，包括转录因子的抑制或激活和microRNAs的转录后降解。biRte利用转录因子、miRNA和可能的其他因子的调控网络，以及mRNA、miRNA和其他可用的表达数据，来预测调控因子对其靶基因表达的相对影响。推理是在使用Markov-Chain-Monte-Carlo的贝叶斯建模框架中完成的。一个特殊的特点是在主动调节器之间进行后续网络逆向工程的可能性。

作者:Holger Froehlich，由Benedikt Zacher贡献

维护器:Holger Froehlich

安装

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文档

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browseVignettes(“birte”)

PDF	R脚本	转录活性调控的贝叶斯推理
PDF		参考手册
文本		自述

细节

biocViews	贝叶斯，GeneExpression，微阵列，网络，NetworkInference，回归，测序，软件，转录
版本	1.14.0
在Bioconductor公司	BioC 3.1 (R-3.2)(3年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.0.0)，RcppArmadillo(> = 0.3.6.1),Rcpp
进口	质量，limma(> = 3.22.0),glmnet，Biobase，nem，图形，统计，效用
链接	RcppArmadillo，Rcpp
建议	knitr
SystemRequirements	布拉斯特区,LAPACK
增强了	Rgraphviz
URL
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	birte_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	birte_1.14.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	birte_1.14.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/birte
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/birte/
软件包下载报告	下载数据