bumphunter

DOI:10.18129 / B9.bioc.bumphunter

撞猎人

Bioconductor版本:Release (3.6)

在基因组数据中发现颠簸的工具

作者:Rafael A. Irizarry [cre, aut]， Martin Aryee [aut]， Kasper Daniel Hansen [aut]， Hector Corrada Bravo [aut]， Shan Andrews [ctb]， Andrew E. Jaffe [ctb]， Harris Jaffe [ctb]， Leonardo Collado-Torres [ctb]

维护者:Rafael A. Irizarry < rafa@jimmy.harvard.edu >

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("bumphunter")

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“bumphunter”)

PDF	R脚本	bumphunter用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，表观遗传学，基础设施，MultipleComparison，软件
版本	1.20.0
在Bioconductor中	BioC 2.12 (R-3.0)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4)，S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges(> = 2.3.23),GenomeInfoDb，GenomicRanges，foreach，迭代器，方法，并行;locfit
进口	matrixStats，limma，doRNG，BiocGenerics跑龙套,GenomicFeatures，AnnotationDbi,统计数据
链接
建议	testthat，RUnit，doParallel，org.Hs.eg.db，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ririzarr/bumphunter
这取决于我	minfi
进口我	冠军，derfinder，methyvim
建议我	derfinderPlot，epivizrData，regionReport
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	bumphunter_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	bumphunter_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	bumphunter_1.20.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bumphunter
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/bumphunter/
软件包下载报告	下载数据