categoryCompare

DOI:10.18129 / B9.bioc.categoryCompare

使用特征注释的高通量实验元分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

计算两个(或多个)特征(即基因)列表中的每个特征(即基因)中的重要注释(类别)，确定注释之间的重叠，并返回关于重要注释的图形和表格数据，以及哪些特征列表组合的注释被发现是显著的。交互式探索可以通过使用RCytoscape(强烈建议使用)来实现。

作者:Robert M. Flight

维护者:Robert M. Flight

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文档

超文本标记语言	R脚本	categoryCompare:使用基因注释的高通量数据元分析
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细节

biocViews	注释，去，GeneExpression，MultipleComparison，通路，软件
版本	1.22.0
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(6年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.10)，Biobase，BiocGenerics(> = 0.13.8)
进口	AnnotationDbi，hwriter，GSEABase，类别(> = 2.33.1),GOstats，注释，色彩，图，RCy3
链接
建议	knitr、方法、GO.db，KEGG.db，雌激素，org.Hs.eg.db，hgu95av2.db，limma，affy，genefilter
SystemRequirements	细胞图(>= 3.2.1)(如果用于结果可视化，强烈建议)
增强了
URL	https://github.com/rmflight/categoryCompare
BugReports	https://github.com/rmflight/categoryCompare/issues
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	categoryCompare_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	categoryCompare_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	categoryCompare_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/categoryCompare
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/categoryCompare/
软件包下载报告	下载数据