魅力

DOI:10.18129 / B9.bioc.charm

DNA甲基化魅力微阵列数据的分析

Bioconductor版本:版本(3.6)

这个方案实现了对DNA甲基化分析工具生成的数据使用罗氏微阵列和McrBC协议。它发现样本之间的差异甲基化区域,计算百分比甲基化估计,包括数组质量评估工具。

作者:马丁·阿尔耶前来彼得村上,哈里斯贾菲,拉斐尔•伊

维护人员:彼得村上< pmurakam jhu.edu >

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细节

biocViews	DNAMethylation,微阵列,软件
版本	2.24.0
Bioconductor自	BioC 2.6 (r - 2.11)(8年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.14.0),Biobase,SQN,字段,RColorBrewer,genefilter
进口	BSgenome,Biobase,益生元(> = 1.11.31),oligoClasses(> = 1.17.39),ff,preprocessCore、方法、统计数据Biostrings,IRanges,siggenes,nor1mix,gtoolsgrDevices,图形,跑龙套,limma平行,股东价值分析(> = 3.1.2)
链接
建议	charmData,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18,corpcor
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	charmData
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	charm_2.24.0.tar.gz
Windows二进制	charm_2.24.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	charm_2.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/charm
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/charm/
包下载报告	下载数据