cleanUpdTSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.cleanUpdTSeq

该包将假定的多聚腺苷酸位点分类为true或false/内部寡核苷酸引物

Bioconductor版本:Release (3.6)

该包使用朴素贝叶斯分类器(来自e1071)根据斑马鱼的训练数据将概率值分配给假定的多聚腺苷酸位点(pA位点)。这将允许用户将真实的、生物学上相关的pA位点从虚假的、寡核苷酸引物的pA位点中分离出来。

作者:Sarah Sheppard，欧建宏，Nathan Lawson，朱丽华

维护者:Sarah Sheppard ;欧建宏<建宏。Ou at umassmed.edu>;朱丽华<朱丽。在umassmed.edu>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“cleanUpdTSeq”)

文档

超文本标记语言	R脚本	cleanUpdTSeq装饰图案
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文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation，遗传学，SequenceMatching，测序，软件
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.15)，BiocGenerics(>= 0.1.0)，BSgenome，BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7，GenomicRanges，seqinr，e1071
进口
链接
建议	BiocStyle，knitr，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	InPAS
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	cleanUpdTSeq_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	cleanUpdTSeq_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	cleanUpdTSeq_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cleanUpdTSeq
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/cleanUpdTSeq/
软件包下载报告	下载数据