clusterExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.clusterExperiment

比较单细胞测序的聚类

Bioconductor版本:Release (3.6)

提供运行和比较单细胞测序数据或其他大型mRNA表达数据集的许多不同聚类的功能。

作者:Elizabeth Purdom [aut, cre, cph]， Davide Risso [aut]， Marla Johnson [ctb]

维护者:Elizabeth Purdom

安装

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文档

超文本标记语言	R脚本	clusterExperiment装饰图案
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文本		新闻

细节

biocViews	聚类，RNASeq，测序，SingleCell，软件
版本	1.4.0
在Bioconductor中	BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4)，SummarizedExperiment
进口	方法,NMF，RColorBrewer，猿，phylobase，集群统计数据,limma，dendextend，多少，locfdr，matrixStats，图形，并行;RSpectra，kernlab，stringr
链接
建议	BiocStyle，knitr，testthat，scRNAseq，桅杆
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/epurdom/clusterExperiment/issues
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包档案

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源包	clusterExperiment_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	clusterExperiment_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	clusterExperiment_1.4.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/clusterExperiment
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/clusterExperiment/
软件包下载报告	下载数据