compcoder

doi:10.18129/b9.bioc.compcoder

RNASEQ数据模拟,差异表达分析和差异表达方法的性能比较

生物导体版本:版本(3.6)

该软件包提供了广泛的功能,用于比较通过不同方法获得的结果进行RNASEQ数据的差异表达分析。它还包含用于模拟计数数据和接口到几个软件包的函数,以执行差异表达分析。

作者:夏洛特·索森(Charlotte Soneson)

维护者:charlotte soneson

引用(从r内,输入引用(“ compcoder”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ compcoder”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ compcoder”)

PDF R脚本 compcoder
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 差异性,,,,rnaseq,,,,软件
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 2.14(R-3.1)(4年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.0.2),SM
进口 TCLTK,尼特(> = 1.2),降价,,,,rocr,,,,格子(> = 0.16),GPLOTS,,,,gtools,,,,gdata,,,,表情, 网格,克恩斯门茶,,,,大量的,,,,GGPLOT2,,,,Stringr,,,,最模式,,,,EDGER,,,,林玛,,,,vioplot, 方法
链接
建议 生物使用,,,,EBSEQ,,,,deseq,,,,deseq2(> = 1.1.31),贝塞克(> = 2.2.0),GeneFilter,,,,Noingsq,,,,TCC,,,,萨姆,,,,NBPSEQ(> = 0.3.0)
系统要求
增强 rpanel,,,,DSS
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 compcoder_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 compcoder_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) compcoder_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compcoder
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/compcoder/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题: