consensusOV

DOI:10.18129 / B9.bioc.consensusOV

高档浆液性卵巢癌的基因亚型分类

Bioconductor版本:版本(3.6)

这个包实现四个主要亚型分类器为高档浆液性卵巢癌(硫化汞)所描述的Helland et al。(PLoS One, 2011), Bentink et al。(PLoS One, 2012), Verhaak et al。(中国投资,2013),和Konecny et al。(中华肿瘤杂志,2014)。此外,包分类器实现了一个共识,巩固和提高在该亚型分类器的鲁棒性,从而提供可靠的硫化汞卵巢肿瘤患者分层明确定义的子类型。

作者:陈Gregory M, Lavanya Kannan,路德维希Geistlinger, Victor Kofia李维Waldron本杰明Haibe-Kains

维护人员:本杰明Haibe-Kains < benjamin.haibe。实物地租在utoronto.ca >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“consensusOV”)

文档

HTML	R脚本	卵巢癌的分子亚型
PDF		参考手册

细节

biocViews	分类,聚类,DifferentialExpression,GeneExpression,微阵列,软件,转录组
版本	1.0.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.4)
进口	Biobase,GSVA,gdata,genefu,limma,matrixStats,randomForest统计,跑龙套
链接
建议	knitr,ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.pmgenomics.ca/bhklab/software/consensusOV
BugReports	https://github.com/bhklab/consensusOV/issues
取决于我
进口我
建议我
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	consensusOV_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	consensusOV_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	consensusOV_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/consensusOV
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/consensusOV/
包下载报告	下载数据