diffuStats

DOI:10.18129 / B9.bioc.diffuStats

生物网络上的扩散得分

Bioconductor版本:Release (3.6)

标签传播方法是计算生物学中广泛使用的程序，用于使用网络数据为分子实体提供上下文。节点标签可以来自基因表达、全基因组关联研究、蛋白质结构域或代谢组学分析，它们被传播到网络中的邻居，通过先前的注释知识有效地平滑分数，并优先考虑新的候选者。R包diffuStats包含一组扩散内核和评分方法，这些方法有助于它们的计算和基准测试。

作者:Sergio Picart-Armada和Alexandre Perera-Lluna

维护者:塞尔吉奥·皮卡特-无敌舰队Picart网址:upc.edu b>

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PDF	R脚本	案例研究:预测蛋白质功能
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文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GraphAndNetwork，网络，软件
版本	0.102.0
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4)
进口	grDevices, stats, methods，矩阵，质量，expm，igraph，Rcpp，RcppArmadillo，RcppParallel，plyr，precrec
链接	Rcpp，RcppArmadillo，RcppParallel
建议	testthat，knitr，rmarkdown，ggplot2，ggsci，igraphdata，BiocStyle，reshape2
SystemRequirements	GNU使
增强了
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这取决于我
进口我
建议我
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包档案

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源包	diffuStats_0.102.0.tar.gz
Windows二进制	diffuStats_0.102.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	diffuStats_0.102.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/diffuStats
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/diffuStats/
软件包下载报告	下载数据