epivizrStandalone

DOI:10.18129 / B9.bioc.epivizrStandalone

运行Epiviz交互式基因组数据可视化应用程序在R

Bioconductor版本:Release (3.6)

这个包导入了epiviz可视化JavaScript应用程序，用于基因组数据交互可视化。“epivizrServer”包用于提供一个完全在r中运行的web服务器。这个独立版本允许通过Bioconductor包提供的基因组注释浏览任意基因组。

作者:Hector Corrada Bravo, Jayaram Kancherla

维护人员:Hector Corrada Bravo

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("epivizrStandalone")

文档

超文本标记语言		epivizrStandalone介绍
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GUI，基础设施，软件，可视化
版本	1.6.0
在Bioconductor公司	BioC 3.3 (R-3.3)(两年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.2.3)，epivizr(>= 2.3.6)方法
进口	git2r，epivizrServer，GenomeInfoDb，BiocGenerics，GenomicFeatures，S4Vectors
链接
建议	testthat，knitr，rmarkdown，OrganismDbi(> = 1.13.9),Mus.musculus，Biobase，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	metavizr
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	epivizrStandalone_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	epivizrStandalone_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	epivizrStandalone_1.6.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/epivizrStandalone
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/epivizrStandalone/
软件包下载报告	下载数据