生物导体版本:版本(3.6)
FlowCatchR是一组用于分析体内显微镜成像数据的工具,重点是跟踪流动的血细胞。它指导从分割到特征计算的步骤,过滤颗粒不感兴趣,还提供了一组公用事业,以帮助检查执行的操作质量(例如,分割的良好程度)。它允许研究跟踪流动细胞(例如血管中)的问题,可以将流动,滚动和粘附的颗粒分类。这种分类应用于止血和血栓形成研究等现象的研究。此外,FlowCatchr基于与闪亮的应用程序和jupyter笔记本电脑的集成,它与包装一起交付,并可以在R环境中启用完全可重现的生物图像分析。
作者:费德里科·马里尼(Federico Marini)[AUT,CRE]
维护者:uni-mainz.de>的Federico Marini
引用(从r内,输入引用(“ FlowCatchr”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ flowcatchr”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ flowcatchr”)
R脚本 | FlowCatchr:时间流逝显微镜图像中的跟踪和分析细胞 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 细胞生物学,,,,分类,,,,GUI,,,,基础设施,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(3.5岁) |
执照 | BSD_3_Clause +文件许可证 |
要看 | R(> = 2.10),方法,ebimage |
进口 | RGL,,,,柱面,,,,艾宾,,,,生物比较 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,闪亮的 |
系统要求 | 成像 |
增强 | |
URL | https://github.com/federicomarini/flowcatchr |
BugReports | https://github.com/federicomarini/flowcatchr/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | flowcatchr_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | FlowCatchr_1.12.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | FlowCatchr_1.12.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowcatchr |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/flowcatchr/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |