gCrisprTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.gCrisprTools

集成的Crispr屏幕质量控制和分析功能套件

Bioconductor版本:Release (3.6)

一套用于评估汇集的高通量筛选实验的工具，通常使用CRISPR/Cas9或shRNA表达盒。包含在实验中询问库和盒行为的方法，识别差异丰富的盒，聚合信号以识别用于经验验证的候选目标，假设检验和综合报告。

作者:Russell Bainer, Dariusz Ratman, Steve Lianoglou, Peter Haverty

维护者:Peter Haverty < Haverty。彼得在gene.com >

安装

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##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("gCrisprTools")

文档

超文本标记语言	R脚本	Example_Workflow_gCrisprTools
超文本标记语言	R脚本	gCrisprTools_Vignette
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BiomedicalInformatics，CRISPR，CellBiology，DifferentialExpression，ExperimentalDesign，FunctionalGenomics，GeneSetEnrichment，遗传学，MultipleComparison，归一化，遗传药理学，药物基因组学，PooledScreens，预处理，质量控制，RNASeq，回归，软件，SystemsBiology，可视化
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.3)
进口	Biobase，limma，RobustRankAggreg，ggplot2，PANTHER.db，rmarkdowngrDevices，图形，统计，utils，并行
链接
建议	刨边机，knitr、网格AnnotationDbi，org.Mm.eg.db，org.Hs.eg.db，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	gCrisprTools_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	gCrisprTools_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	gCrisprTools_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gCrisprTools
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/gCrisprTools/
包下载报告	下载数据