GCAPC

doi:10.18129/b9.bioc.gcapc

GC意识到高峰呼叫者

生物导体版本:版本(3.6)

在测序读取中考虑了潜在的GC偏置,峰值要求芯片序列数据。首先,使用有效的GC策略估算GC偏置,然后使用一般的线性混合模型估算,然后应用于峰值显着性估计。

作者:Mingxiang Teng和Rafael A. Irizarry

维护者:mingxiang teng

引用(从r内,输入引用(“ GCAPC”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ gcapc”)

文档

html R脚本 GCAPC用户指南
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 批处理效应,,,,chipseq,,,,峰值探测,,,,测序,,,,软件
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(1年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.4)
进口 生物基因,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,生物弦,,,,BSGENOME,,,,基因组机,,,,rsamtools,,,,基因组签名,,,,矩阵,,,,大量的,花键,grdevices,图形,统计,方法
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10
系统要求
增强
URL https://github.com/tengmx/gcapc
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 gcapc_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 gcapc_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) gcapc_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gcapc
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/gcapc/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题: